随着经济的飞速发展，工业化程度的迅速提升，虽然人民的生活水平得到了显著的提升，但同时环境污染、资源紧缺、生态遭受破坏的问题却日益严重，这严重对人民的日常生活造成了影响。而我国是世界上人口最多的国家，虽然一些资源较为丰富，但在资源储备的人均水平上我国的情况并不乐观，如今我国经济的发展和环境的矛盾越来越冲突，其中较为严重的就有水资源的匮乏和水资源的污染问题。而跨区域的水污染更是难以治理成为了我国环境污染问题中的难题。在我国的母亲河长江和黄河流域中也都受到了不同程度的影响，甚至造成了一定的生物灭绝，例如长江白鲟灭绝现象的产生。我国虽然在过去对跨区域的水污染采取了一定的治理措施并取得了一定的成就，但在一些地区水污染治理并没有被根本解决而是治标不治本，时常出现反复治理复发的情况。造成水污染治理困境总体上是因为水污染治理体系不完善，区域政府间合作效率不高导致的。落实到具体的情况时还存在经济发展水平低限制了污染治理，治理方式不科学等原因。